Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YXY3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YXY3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
A0A0J9YXY3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
A0A0J9YXY3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
A0A0J9YXY3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
A0A0J9YXY3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
A0A0J9YXY3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
A0A0J9YXY3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
A0A0J9YXY3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
A0A0J9YXY3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
A0A0J9YXY3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
A0A0J9YXY3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
A0A0J9YXY3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
A0A0J9YXY3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
A0A0J9YXY3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
A0A0J9YXY3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
A0A0J9YXY3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
A0A0J9YXY3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
A0A0J9YXY3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
A0A0J9YXY3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A0J9YXY3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A0J9YXY3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A0J9YXY3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A0J9YXY3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A0J9YXY3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A0J9YXY3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A0J9YXY3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A0J9YXY3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A0J9YXY3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A0J9YXY3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A0J9YXY3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A0J9YXY3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A0J9YXY3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A0J9YXY3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A0J9YXY3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A0J9YXY3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A0J9YXY3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A0J9YXY3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A0J9YXY3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A0J9YXY3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A0J9YXY3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A0J9YXY3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A0J9YXY3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A0J9YXY3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A0J9YXY3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A0J9YXY3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A0J9YXY3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A0J9YXY3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A0J9YXY3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A0J9YXY3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A0J9YXY3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A0J9YXY3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A0J9YXY3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A0J9YXY3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A0J9YXY3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A0J9YXY3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A0J9YXY3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A0J9YXY3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A0J9YXY3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A0J9YXY3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A0J9YXY3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A0J9YXY3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A0J9YXY3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A0J9YXY3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A0J9YXY3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A0J9YXY3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A0J9YXY3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A0J9YXY3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A0J9YXY3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A0J9YXY3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A0J9YXY3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A0J9YXY3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A0J9YXY3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A0J9YXY3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A0J9YXY3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A0J9YXY3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A0J9YXY3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A0J9YXY3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A0J9YXY3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A0J9YXY3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A0J9YXY3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A0J9YXY3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A0J9YXY3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A0J9YXY3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
A0A0J9YXY3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
A0A0J9YXY3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
A0A0J9YXY3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
A0A0J9YXY3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
A0A0J9YXY3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A0A0J9YXY3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A0A0J9YXY3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
A0A0J9YXY3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A0A0J9YXY3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A0A0J9YXY3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A0A0J9YXY3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A0A0J9YXY3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A0J9YXY3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A0J9YXY3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A0J9YXY3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A0J9YXY3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A0J9YXY3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms