Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
SHANK2Q9UPX8 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms