Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms