Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms