Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
VAPAQ9P0L0 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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VAPAQ9P0L0 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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VAPAQ9P0L0 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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VAPAQ9P0L0 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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VAPAQ9P0L0 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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VAPAQ9P0L0 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VAPAQ9P0L0 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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