Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
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GDE1Q9NZC3 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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GDE1Q9NZC3 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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GDE1Q9NZC3 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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GDE1Q9NZC3 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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GDE1Q9NZC3 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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GDE1Q9NZC3 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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GDE1Q9NZC3 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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GDE1Q9NZC3 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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GDE1Q9NZC3 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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GDE1Q9NZC3 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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GDE1Q9NZC3 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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GDE1Q9NZC3 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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GDE1Q9NZC3 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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GDE1Q9NZC3 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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GDE1Q9NZC3 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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