Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms