Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms