Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD1Q9BXT4 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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