Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPOCK3Q9BQ16 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms