Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EYA3Q99504 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms