Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM4

NXNL1, Nucleoredoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXNL1Q96CM4 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NXNL1Q96CM4 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.1 ms