Protein–RNA interactions for Protein: Q96BY7

ATG2B, Autophagy-related protein 2 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG2BQ96BY7 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms