Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBP0

TTC13, Tetratricopeptide repeat protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC13Q8NBP0 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 AC108673.2-201ENST00000608909 565 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 AL357833.2-202ENST00000413757 372 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 AL603841.1-201ENST00000430516 664 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC13Q8NBP0 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms