Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms