Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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COL24A1Q17RW2 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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