Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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