Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SEC23BQ15437 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms