Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
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RAB35Q15286 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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RAB35Q15286 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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RAB35Q15286 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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RAB35Q15286 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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RAB35Q15286 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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RAB35Q15286 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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