Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2H3Q13889 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms