Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 AC010503.4-201ENST00000615487 688 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
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