Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRQ13535 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRQ13535 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRQ13535 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRQ13535 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRQ13535 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRQ13535 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRQ13535 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRQ13535 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRQ13535 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRQ13535 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRQ13535 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRQ13535 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRQ13535 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRQ13535 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRQ13535 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRQ13535 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRQ13535 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRQ13535 DYNLT1-201ENST00000367085 774 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRQ13535 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRQ13535 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRQ13535 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRQ13535 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRQ13535 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRQ13535 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRQ13535 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRQ13535 AC007656.1-201ENST00000552238 573 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRQ13535 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRQ13535 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRQ13535 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRQ13535 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRQ13535 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRQ13535 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRQ13535 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRQ13535 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRQ13535 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRQ13535 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRQ13535 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRQ13535 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRQ13535 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRQ13535 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRQ13535 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRQ13535 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRQ13535 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRQ13535 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRQ13535 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRQ13535 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRQ13535 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRQ13535 AC087071.1-201ENST00000469264 427 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRQ13535 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRQ13535 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRQ13535 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRQ13535 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRQ13535 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRQ13535 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRQ13535 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRQ13535 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRQ13535 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRQ13535 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRQ13535 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRQ13535 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRQ13535 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRQ13535 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRQ13535 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRQ13535 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRQ13535 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRQ13535 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRQ13535 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRQ13535 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRQ13535 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRQ13535 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRQ13535 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRQ13535 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRQ13535 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRQ13535 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRQ13535 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRQ13535 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRQ13535 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRQ13535 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRQ13535 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRQ13535 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRQ13535 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRQ13535 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRQ13535 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRQ13535 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRQ13535 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRQ13535 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRQ13535 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRQ13535 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRQ13535 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRQ13535 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
ATRQ13535 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
ATRQ13535 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
ATRQ13535 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATRQ13535 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATRQ13535 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATRQ13535 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATRQ13535 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATRQ13535 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ATRQ13535 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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