Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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