Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA3Q08378 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA3Q08378 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA3Q08378 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA3Q08378 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA3Q08378 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA3Q08378 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA3Q08378 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA3Q08378 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA3Q08378 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA3Q08378 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA3Q08378 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA3Q08378 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA3Q08378 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA3Q08378 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA3Q08378 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA3Q08378 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA3Q08378 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA3Q08378 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA3Q08378 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA3Q08378 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA3Q08378 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA3Q08378 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA3Q08378 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA3Q08378 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA3Q08378 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA3Q08378 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA3Q08378 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GOLGA3Q08378 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GOLGA3Q08378 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GOLGA3Q08378 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GOLGA3Q08378 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GOLGA3Q08378 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GOLGA3Q08378 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GOLGA3Q08378 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GOLGA3Q08378 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GOLGA3Q08378 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GOLGA3Q08378 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GOLGA3Q08378 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
GOLGA3Q08378 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GOLGA3Q08378 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GOLGA3Q08378 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
GOLGA3Q08378 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GOLGA3Q08378 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GOLGA3Q08378 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
GOLGA3Q08378 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GOLGA3Q08378 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GOLGA3Q08378 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GOLGA3Q08378 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GOLGA3Q08378 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GOLGA3Q08378 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GOLGA3Q08378 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GOLGA3Q08378 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GOLGA3Q08378 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
GOLGA3Q08378 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GOLGA3Q08378 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GOLGA3Q08378 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms