Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DDR1Q08345 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
DDR1Q08345 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DDR1Q08345 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DDR1Q08345 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DDR1Q08345 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DDR1Q08345 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DDR1Q08345 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DDR1Q08345 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DDR1Q08345 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
DDR1Q08345 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DDR1Q08345 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms