Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDE4BQ07343 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms