Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP7AQ04656 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP7AQ04656 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms