Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDR2Q01850 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms