Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX1P83916 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX1P83916 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX1P83916 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX1P83916 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX1P83916 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX1P83916 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX1P83916 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX1P83916 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX1P83916 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX1P83916 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX1P83916 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX1P83916 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX1P83916 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX1P83916 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX1P83916 BTNL8-201ENST00000231229 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX1P83916 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX1P83916 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX1P83916 ACADM-201ENST00000370834 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX1P83916 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX1P83916 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX1P83916 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX1P83916 FAM76A-204ENST00000373954 3567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX1P83916 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX1P83916 TMEM233-201ENST00000426426 3081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX1P83916 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX1P83916 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX1P83916 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX1P83916 ASCC3-203ENST00000369143 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX1P83916 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX1P83916 MKX-201ENST00000375790 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX1P83916 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX1P83916 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX1P83916 NFKB1-202ENST00000394820 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX1P83916 ATXN2L-225ENST00000570200 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX1P83916 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX1P83916 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX1P83916 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX1P83916 PER1-202ENST00000354903 3115 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX1P83916 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX1P83916 PRAM1-201ENST00000423345 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX1P83916 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX1P83916 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX1P83916 FAM214B-208ENST00000605244 3016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX1P83916 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX1P83916 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX1P83916 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX1P83916 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX1P83916 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX1P83916 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX1P83916 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX1P83916 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX1P83916 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX1P83916 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX1P83916 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX1P83916 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX1P83916 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX1P83916 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX1P83916 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX1P83916 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX1P83916 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX1P83916 BCAM-211ENST00000611077 3430 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX1P83916 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX1P83916 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX1P83916 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX1P83916 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX1P83916 TRIM3-203ENST00000525074 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX1P83916 AC145098.2-201ENST00000623593 3026 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX1P83916 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX1P83916 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX1P83916 C3orf38-201ENST00000318887 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX1P83916 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX1P83916 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX1P83916 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX1P83916 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX1P83916 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX1P83916 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX1P83916 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX1P83916 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX1P83916 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX1P83916 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX1P83916 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX1P83916 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX1P83916 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX1P83916 ATG5-202ENST00000360666 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX1P83916 INTS13-201ENST00000261191 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX1P83916 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX1P83916 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX1P83916 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX1P83916 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX1P83916 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX1P83916 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX1P83916 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX1P83916 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX1P83916 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX1P83916 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX1P83916 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX1P83916 ARAF-203ENST00000377045 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX1P83916 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBX1P83916 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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