Protein–RNA interactions for Protein: P82980

RBP5, Retinol-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP5P82980 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBP5P82980 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBP5P82980 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RBP5P82980 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBP5P82980 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBP5P82980 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RBP5P82980 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBP5P82980 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBP5P82980 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBP5P82980 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBP5P82980 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBP5P82980 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBP5P82980 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBP5P82980 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBP5P82980 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBP5P82980 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBP5P82980 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBP5P82980 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBP5P82980 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBP5P82980 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBP5P82980 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RBP5P82980 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RBP5P82980 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBP5P82980 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBP5P82980 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBP5P82980 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBP5P82980 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RBP5P82980 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBP5P82980 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBP5P82980 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBP5P82980 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBP5P82980 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBP5P82980 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RBP5P82980 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RBP5P82980 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBP5P82980 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBP5P82980 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBP5P82980 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBP5P82980 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RBP5P82980 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBP5P82980 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBP5P82980 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBP5P82980 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBP5P82980 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBP5P82980 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBP5P82980 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RBP5P82980 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBP5P82980 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBP5P82980 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBP5P82980 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBP5P82980 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBP5P82980 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBP5P82980 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBP5P82980 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBP5P82980 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBP5P82980 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBP5P82980 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBP5P82980 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBP5P82980 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBP5P82980 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBP5P82980 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBP5P82980 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBP5P82980 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBP5P82980 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBP5P82980 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBP5P82980 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBP5P82980 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBP5P82980 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBP5P82980 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBP5P82980 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RBP5P82980 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBP5P82980 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBP5P82980 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBP5P82980 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBP5P82980 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBP5P82980 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RBP5P82980 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBP5P82980 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBP5P82980 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBP5P82980 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBP5P82980 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBP5P82980 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBP5P82980 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBP5P82980 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBP5P82980 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBP5P82980 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBP5P82980 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBP5P82980 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBP5P82980 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBP5P82980 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBP5P82980 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBP5P82980 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBP5P82980 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBP5P82980 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBP5P82980 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBP5P82980 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBP5P82980 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBP5P82980 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBP5P82980 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBP5P82980 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms