Protein–RNA interactions for Protein: P56704

WNT3A, Protein Wnt-3a, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WNT3AP56704 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms