Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms