Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms