Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DAP3P51398 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DAP3P51398 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DAP3P51398 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DAP3P51398 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DAP3P51398 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DAP3P51398 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DAP3P51398 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DAP3P51398 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DAP3P51398 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DAP3P51398 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DAP3P51398 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DAP3P51398 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DAP3P51398 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DAP3P51398 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DAP3P51398 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DAP3P51398 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DAP3P51398 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DAP3P51398 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DAP3P51398 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DAP3P51398 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DAP3P51398 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DAP3P51398 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DAP3P51398 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DAP3P51398 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DAP3P51398 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DAP3P51398 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DAP3P51398 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DAP3P51398 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
DAP3P51398 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DAP3P51398 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
DAP3P51398 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
DAP3P51398 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DAP3P51398 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DAP3P51398 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DAP3P51398 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DAP3P51398 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DAP3P51398 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DAP3P51398 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DAP3P51398 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DAP3P51398 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DAP3P51398 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
DAP3P51398 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DAP3P51398 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DAP3P51398 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DAP3P51398 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DAP3P51398 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DAP3P51398 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DAP3P51398 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DAP3P51398 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DAP3P51398 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DAP3P51398 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DAP3P51398 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DAP3P51398 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DAP3P51398 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DAP3P51398 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DAP3P51398 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DAP3P51398 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DAP3P51398 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DAP3P51398 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DAP3P51398 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DAP3P51398 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DAP3P51398 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DAP3P51398 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
DAP3P51398 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DAP3P51398 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
DAP3P51398 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
DAP3P51398 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
DAP3P51398 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
DAP3P51398 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DAP3P51398 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DAP3P51398 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DAP3P51398 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DAP3P51398 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
DAP3P51398 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DAP3P51398 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DAP3P51398 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DAP3P51398 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DAP3P51398 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DAP3P51398 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DAP3P51398 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DAP3P51398 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
DAP3P51398 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
DAP3P51398 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
DAP3P51398 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
DAP3P51398 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DAP3P51398 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DAP3P51398 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DAP3P51398 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DAP3P51398 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
DAP3P51398 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
DAP3P51398 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
DAP3P51398 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
DAP3P51398 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
DAP3P51398 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
DAP3P51398 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
DAP3P51398 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DAP3P51398 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
DAP3P51398 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
DAP3P51398 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.3 ms