Protein–RNA interactions for Protein: P43304

GPD2, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD2P43304 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPD2P43304 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GPD2P43304 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GPD2P43304 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPD2P43304 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPD2P43304 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPD2P43304 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPD2P43304 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPD2P43304 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPD2P43304 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GPD2P43304 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GPD2P43304 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GPD2P43304 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPD2P43304 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPD2P43304 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPD2P43304 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPD2P43304 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPD2P43304 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPD2P43304 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPD2P43304 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPD2P43304 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPD2P43304 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPD2P43304 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPD2P43304 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPD2P43304 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GPD2P43304 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPD2P43304 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GPD2P43304 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPD2P43304 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPD2P43304 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPD2P43304 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPD2P43304 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPD2P43304 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPD2P43304 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPD2P43304 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPD2P43304 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPD2P43304 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPD2P43304 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPD2P43304 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPD2P43304 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPD2P43304 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPD2P43304 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPD2P43304 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPD2P43304 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPD2P43304 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPD2P43304 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPD2P43304 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPD2P43304 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPD2P43304 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPD2P43304 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPD2P43304 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPD2P43304 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPD2P43304 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPD2P43304 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPD2P43304 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPD2P43304 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPD2P43304 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GPD2P43304 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPD2P43304 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPD2P43304 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPD2P43304 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPD2P43304 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPD2P43304 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPD2P43304 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPD2P43304 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPD2P43304 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPD2P43304 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPD2P43304 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPD2P43304 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPD2P43304 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPD2P43304 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPD2P43304 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPD2P43304 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPD2P43304 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPD2P43304 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPD2P43304 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPD2P43304 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPD2P43304 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPD2P43304 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPD2P43304 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPD2P43304 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPD2P43304 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GPD2P43304 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GPD2P43304 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GPD2P43304 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GPD2P43304 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GPD2P43304 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GPD2P43304 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GPD2P43304 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GPD2P43304 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPD2P43304 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPD2P43304 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPD2P43304 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPD2P43304 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPD2P43304 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GPD2P43304 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPD2P43304 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPD2P43304 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPD2P43304 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPD2P43304 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms