Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK1P39086 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK1P39086 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK1P39086 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK1P39086 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK1P39086 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK1P39086 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK1P39086 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK1P39086 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK1P39086 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK1P39086 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK1P39086 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK1P39086 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK1P39086 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK1P39086 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK1P39086 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK1P39086 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK1P39086 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK1P39086 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK1P39086 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK1P39086 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK1P39086 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK1P39086 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK1P39086 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK1P39086 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK1P39086 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK1P39086 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK1P39086 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK1P39086 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK1P39086 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK1P39086 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK1P39086 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK1P39086 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK1P39086 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK1P39086 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK1P39086 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK1P39086 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK1P39086 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK1P39086 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK1P39086 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK1P39086 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK1P39086 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK1P39086 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK1P39086 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GRIK1P39086 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK1P39086 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK1P39086 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK1P39086 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK1P39086 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK1P39086 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK1P39086 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK1P39086 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK1P39086 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK1P39086 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK1P39086 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK1P39086 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK1P39086 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK1P39086 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK1P39086 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK1P39086 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK1P39086 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK1P39086 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK1P39086 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK1P39086 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK1P39086 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK1P39086 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK1P39086 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK1P39086 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK1P39086 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK1P39086 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK1P39086 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK1P39086 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK1P39086 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK1P39086 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK1P39086 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK1P39086 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK1P39086 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK1P39086 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK1P39086 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK1P39086 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK1P39086 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK1P39086 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK1P39086 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK1P39086 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK1P39086 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK1P39086 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK1P39086 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK1P39086 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIK1P39086 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK1P39086 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK1P39086 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK1P39086 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK1P39086 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK1P39086 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK1P39086 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK1P39086 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK1P39086 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK1P39086 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK1P39086 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK1P39086 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms