Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms