Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM23P36406 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM23P36406 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM23P36406 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM23P36406 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM23P36406 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM23P36406 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM23P36406 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM23P36406 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM23P36406 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM23P36406 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM23P36406 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM23P36406 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
TRIM23P36406 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.05■□□□□ 0
TRIM23P36406 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TRIM23P36406 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRIM23P36406 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRIM23P36406 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TRIM23P36406 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRIM23P36406 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TRIM23P36406 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TRIM23P36406 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRIM23P36406 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRIM23P36406 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRIM23P36406 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM23P36406 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TRIM23P36406 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM23P36406 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM23P36406 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM23P36406 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM23P36406 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM23P36406 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TRIM23P36406 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM23P36406 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM23P36406 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM23P36406 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM23P36406 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM23P36406 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM23P36406 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM23P36406 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TRIM23P36406 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TRIM23P36406 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TRIM23P36406 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TRIM23P36406 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM23P36406 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM23P36406 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TRIM23P36406 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM23P36406 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM23P36406 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM23P36406 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM23P36406 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM23P36406 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM23P36406 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TRIM23P36406 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM23P36406 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM23P36406 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM23P36406 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM23P36406 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM23P36406 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM23P36406 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TRIM23P36406 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM23P36406 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM23P36406 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM23P36406 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM23P36406 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM23P36406 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM23P36406 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM23P36406 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM23P36406 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM23P36406 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM23P36406 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM23P36406 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM23P36406 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM23P36406 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM23P36406 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM23P36406 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM23P36406 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM23P36406 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM23P36406 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM23P36406 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM23P36406 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM23P36406 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM23P36406 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM23P36406 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM23P36406 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TRIM23P36406 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM23P36406 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM23P36406 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM23P36406 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM23P36406 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM23P36406 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TRIM23P36406 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM23P36406 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM23P36406 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM23P36406 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM23P36406 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TRIM23P36406 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM23P36406 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM23P36406 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM23P36406 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms