Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms