Protein–RNA interactions for Protein: P29120

PCSK1, Neuroendocrine convertase 1, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1P29120 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCSK1P29120 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms