Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTSSP25774 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CTSSP25774 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTSSP25774 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTSSP25774 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTSSP25774 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTSSP25774 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTSSP25774 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTSSP25774 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTSSP25774 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTSSP25774 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTSSP25774 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTSSP25774 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTSSP25774 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTSSP25774 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTSSP25774 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSSP25774 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSSP25774 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSSP25774 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSSP25774 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSSP25774 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSSP25774 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSSP25774 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSSP25774 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSSP25774 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSSP25774 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSSP25774 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSSP25774 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSSP25774 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSSP25774 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSSP25774 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSSP25774 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSSP25774 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSSP25774 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSSP25774 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSSP25774 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSSP25774 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSSP25774 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSSP25774 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSSP25774 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSSP25774 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSSP25774 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSSP25774 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSSP25774 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSSP25774 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSSP25774 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSSP25774 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSSP25774 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSSP25774 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSSP25774 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSSP25774 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSSP25774 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSSP25774 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSSP25774 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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CTSSP25774 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSSP25774 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSSP25774 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSSP25774 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSSP25774 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSSP25774 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSSP25774 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSSP25774 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSSP25774 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSSP25774 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSSP25774 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSSP25774 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSSP25774 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSSP25774 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTSSP25774 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTSSP25774 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTSSP25774 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTSSP25774 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTSSP25774 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CTSSP25774 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CTSSP25774 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTSSP25774 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTSSP25774 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTSSP25774 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTSSP25774 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTSSP25774 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CTSSP25774 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTSSP25774 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTSSP25774 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTSSP25774 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTSSP25774 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTSSP25774 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTSSP25774 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CTSSP25774 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTSSP25774 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTSSP25774 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTSSP25774 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTSSP25774 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTSSP25774 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTSSP25774 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTSSP25774 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTSSP25774 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTSSP25774 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTSSP25774 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CTSSP25774 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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