Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRDP23468 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms