Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
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PTPRAP18433 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
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PTPRAP18433 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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PTPRAP18433 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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PTPRAP18433 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
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PTPRAP18433 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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PTPRAP18433 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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PTPRAP18433 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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PTPRAP18433 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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PTPRAP18433 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
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PTPRAP18433 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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PTPRAP18433 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRAP18433 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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