Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODC1P11926 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODC1P11926 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ODC1P11926 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODC1P11926 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODC1P11926 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODC1P11926 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ODC1P11926 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODC1P11926 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODC1P11926 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODC1P11926 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODC1P11926 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODC1P11926 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODC1P11926 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODC1P11926 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODC1P11926 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODC1P11926 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODC1P11926 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODC1P11926 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODC1P11926 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ODC1P11926 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ODC1P11926 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODC1P11926 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODC1P11926 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODC1P11926 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODC1P11926 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODC1P11926 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODC1P11926 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODC1P11926 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODC1P11926 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ODC1P11926 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ODC1P11926 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ODC1P11926 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ODC1P11926 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ODC1P11926 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ODC1P11926 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ODC1P11926 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ODC1P11926 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ODC1P11926 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODC1P11926 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODC1P11926 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODC1P11926 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODC1P11926 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODC1P11926 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODC1P11926 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODC1P11926 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODC1P11926 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODC1P11926 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODC1P11926 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODC1P11926 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODC1P11926 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODC1P11926 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODC1P11926 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODC1P11926 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODC1P11926 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODC1P11926 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODC1P11926 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODC1P11926 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODC1P11926 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODC1P11926 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODC1P11926 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODC1P11926 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODC1P11926 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODC1P11926 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODC1P11926 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODC1P11926 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODC1P11926 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODC1P11926 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODC1P11926 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODC1P11926 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODC1P11926 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODC1P11926 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODC1P11926 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODC1P11926 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODC1P11926 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODC1P11926 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODC1P11926 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODC1P11926 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODC1P11926 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODC1P11926 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODC1P11926 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODC1P11926 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODC1P11926 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODC1P11926 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ODC1P11926 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODC1P11926 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODC1P11926 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODC1P11926 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODC1P11926 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODC1P11926 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ODC1P11926 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODC1P11926 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODC1P11926 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODC1P11926 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODC1P11926 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODC1P11926 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODC1P11926 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODC1P11926 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODC1P11926 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODC1P11926 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167.4 ms