Protein–RNA interactions for Protein: P07988

SFTPB, Pulmonary surfactant-associated protein B, humanhuman

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Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPBP07988 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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SFTPBP07988 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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