Protein–RNA interactions for Protein: O95985

TOP3B, DNA topoisomerase 3-beta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BO95985 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOP3BO95985 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOP3BO95985 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOP3BO95985 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOP3BO95985 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOP3BO95985 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOP3BO95985 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOP3BO95985 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOP3BO95985 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOP3BO95985 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOP3BO95985 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOP3BO95985 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOP3BO95985 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOP3BO95985 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOP3BO95985 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOP3BO95985 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOP3BO95985 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TOP3BO95985 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOP3BO95985 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOP3BO95985 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOP3BO95985 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TOP3BO95985 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TOP3BO95985 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOP3BO95985 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOP3BO95985 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOP3BO95985 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOP3BO95985 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOP3BO95985 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOP3BO95985 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOP3BO95985 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOP3BO95985 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOP3BO95985 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TOP3BO95985 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TOP3BO95985 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TOP3BO95985 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TOP3BO95985 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TOP3BO95985 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TOP3BO95985 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TOP3BO95985 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TOP3BO95985 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TOP3BO95985 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TOP3BO95985 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TOP3BO95985 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TOP3BO95985 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TOP3BO95985 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TOP3BO95985 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TOP3BO95985 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TOP3BO95985 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TOP3BO95985 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TOP3BO95985 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TOP3BO95985 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TOP3BO95985 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TOP3BO95985 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TOP3BO95985 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TOP3BO95985 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TOP3BO95985 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TOP3BO95985 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TOP3BO95985 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TOP3BO95985 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TOP3BO95985 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TOP3BO95985 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TOP3BO95985 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TOP3BO95985 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TOP3BO95985 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TOP3BO95985 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms