Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NDUFS4O43181 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms