Protein–RNA interactions for Protein: O15068

MCF2L, Guanine nucleotide exchange factor DBS, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2LO15068 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MCF2LO15068 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms