Protein–RNA interactions for Protein: O00507

USP9Y, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-Y, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YO00507 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
USP9YO00507 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
USP9YO00507 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
USP9YO00507 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
USP9YO00507 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
USP9YO00507 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
USP9YO00507 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
USP9YO00507 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
USP9YO00507 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
USP9YO00507 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
USP9YO00507 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
USP9YO00507 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
USP9YO00507 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
USP9YO00507 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
USP9YO00507 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
USP9YO00507 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
USP9YO00507 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
USP9YO00507 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
USP9YO00507 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
USP9YO00507 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
USP9YO00507 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
USP9YO00507 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
USP9YO00507 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
USP9YO00507 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
USP9YO00507 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
USP9YO00507 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
USP9YO00507 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
USP9YO00507 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
USP9YO00507 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
USP9YO00507 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
USP9YO00507 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
USP9YO00507 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC13□□□□□ -0.33
USP9YO00507 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
USP9YO00507 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
USP9YO00507 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
USP9YO00507 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
USP9YO00507 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
USP9YO00507 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
USP9YO00507 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
USP9YO00507 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
USP9YO00507 C11orf1-202ENST00000528125 534 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
USP9YO00507 AP004550.1-201ENST00000532652 514 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
USP9YO00507 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
USP9YO00507 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
USP9YO00507 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
USP9YO00507 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC13□□□□□ -0.33
USP9YO00507 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
USP9YO00507 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
USP9YO00507 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
USP9YO00507 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
USP9YO00507 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
USP9YO00507 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
USP9YO00507 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
USP9YO00507 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
USP9YO00507 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9YO00507 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9YO00507 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9YO00507 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9YO00507 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9YO00507 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9YO00507 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9YO00507 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9YO00507 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9YO00507 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9YO00507 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9YO00507 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9YO00507 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9YO00507 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9YO00507 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9YO00507 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9YO00507 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9YO00507 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9YO00507 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9YO00507 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9YO00507 KRT17P4-203ENST00000579355 621 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9YO00507 AL353997.6-201ENST00000583394 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9YO00507 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9YO00507 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9YO00507 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9YO00507 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9YO00507 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9YO00507 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9YO00507 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9YO00507 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9YO00507 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9YO00507 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9YO00507 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9YO00507 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9YO00507 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9YO00507 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9YO00507 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9YO00507 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9YO00507 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9YO00507 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9YO00507 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9YO00507 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9YO00507 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9YO00507 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9YO00507 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9YO00507 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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