Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms